根據(jù)監(jiān)管物件的不同，海關(guān)監(jiān)管分為運(yùn)輸工具監(jiān)管、貨物監(jiān)管、和物品監(jiān)管三大體系，每個體系都有一整套規(guī)范的管理程式與方法。監(jiān)管是海關(guān)最基本的任務(wù)，海關(guān) 的其他任務(wù)都是在監(jiān)管工作的基礎(chǔ)上進(jìn)行的。除了通過備案、審單、查驗、放行、后續(xù)管理等方式對進(jìn)出境運(yùn)輸工具、貨物、物品的進(jìn)出境活動實施監(jiān)管外，海關(guān)監(jiān) 管還要執(zhí)行或監(jiān)督執(zhí)行國家其他對外貿(mào)易管理制度的實施，如進(jìn)出口許可制度、外匯管理制度、進(jìn)出口商品檢驗檢疫制度、文物管理制度等，從而在政治、經(jīng)濟(jì)、文 化道德、公眾健康等方面維護(hù)國家利益。
    1、一般貿(mào)易監(jiān)管
    一般貿(mào)易是指中國境內(nèi)有進(jìn)出口權(quán)的企業(yè)單邊進(jìn)口或單邊出口的貿(mào)易。這種貿(mào)易方式主要有申報、查驗、征稅、放行四個環(huán)節(jié)，海關(guān)對其的監(jiān)管也是由此四個環(huán)節(jié)展開。
    (一)進(jìn)出口申報
    進(jìn)出口貨物收發(fā)貨人、受委托的報關(guān)企業(yè)，依照《海關(guān)法》以及有關(guān)法律、法規(guī)的要求，在規(guī)定的期限(進(jìn)口貨物為進(jìn)境之日起十四天內(nèi)，出口貨物運(yùn)抵海關(guān)監(jiān)管區(qū) 后裝貨的二十四小時前)，進(jìn)出境貨物的口岸或關(guān)境，采用電子資料報關(guān)單和紙質(zhì)報關(guān)單形式，向海關(guān)報告實際進(jìn)出口貨物的情況，海關(guān)以申報資料(商業(yè)發(fā)票、裝箱單 等相關(guān)單證)對照報關(guān)進(jìn)行審核。進(jìn)口貨物收發(fā)貨人未按規(guī)定期限向海關(guān)申報產(chǎn)生滯報的，由海關(guān)按規(guī)定征收滯報金。海關(guān)接受進(jìn)出口貨物申報后，電子資料和紙質(zhì) 的進(jìn)出口貨物報關(guān)單不得修改或者撤銷;確有正當(dāng)理由的，經(jīng)海關(guān)審核批準(zhǔn)，可以修改或撤銷。
    (二)配合查驗 外 貿(mào) 知 識
    海關(guān)為確定進(jìn)出境貨物收發(fā)貨人向海關(guān)申報的內(nèi)容是否與進(jìn)出口貨物的真實相符，或者為確定商品的海關(guān)編碼、價格、原產(chǎn)地等，依法對進(jìn)出口貨物進(jìn)行實際核查。通過實際核查，檢查報關(guān)單位是否偽報、瞞報、申報不實，同時也為海關(guān)的征稅、統(tǒng)計、后續(xù)管理提供可靠的資料。
    查驗的實施一般在海關(guān)監(jiān)管區(qū)內(nèi)執(zhí)行，也有特殊的原因需要在海關(guān)監(jiān)管區(qū)外執(zhí)行的。海關(guān)查驗的方法可以徹底查驗，也可以抽查;查驗的操作分為人工查驗和設(shè)備查驗。
    海關(guān)查驗貨物時進(jìn)出口貨物收發(fā)貨人或其代理人應(yīng)當(dāng)?shù)綀雠浜喜轵?，查驗結(jié)束后，海關(guān)查驗人員填寫《海關(guān)進(jìn)出境貨物查驗記錄單》現(xiàn)場人員簽名確認(rèn)，查驗過程如因查驗人員的責(zé)任發(fā)生損壞，屬海關(guān)賠償范圍的，海關(guān)依法賠償。
    (三)繳納稅費(fèi)
    貨物經(jīng)過申報、查驗環(huán)節(jié)后，海關(guān)核對電腦計算的稅費(fèi)，開具稅款繳款書和收費(fèi)票據(jù)，進(jìn)出口貨物收發(fā)貨人或其代理人在規(guī)定時間內(nèi)，向指定銀行辦理稅費(fèi)交付手續(xù)或通過網(wǎng)路進(jìn)行電子支付。
    (四)放行(提取或裝運(yùn)貨物)
    海關(guān)接受進(jìn)出口貨物的申報，審核申報資料及相關(guān)單證，并且貨物通過上述申報、查驗、征稅環(huán)節(jié)后，對一般貿(mào)易進(jìn)出口貨物結(jié)束海關(guān)進(jìn)出境現(xiàn)場監(jiān)管，允許進(jìn)出口貨物離開海關(guān)監(jiān)管現(xiàn)場的工作環(huán)節(jié)。
    在實行“無紙通關(guān)”申報方式的海關(guān)，海關(guān)做出現(xiàn)場旅行的決定后，通過電腦將資訊發(fā)送給進(jìn)出口貨物收發(fā)貨人或其代理人和海關(guān)監(jiān)管貨物保管人，進(jìn)出口貨物收發(fā)貨人或其代理人自行列印海關(guān)放行通知書，提取或裝運(yùn)貨物。
    2、加工貿(mào)易監(jiān)管
    外資企業(yè)主要以加工貿(mào)易的方式經(jīng)營。海關(guān)以往的加工貿(mào)易監(jiān)管規(guī)定往往只是針對特定時期的某一種貿(mào)易方式或某一項業(yè)務(wù)而制定，缺乏一部系統(tǒng)的、全面的監(jiān)管規(guī) 章。另外，多數(shù)加工貿(mào)易的監(jiān)管規(guī)定制定的立法環(huán)境、條件與現(xiàn)在相比已發(fā)生很大變化，有些規(guī)定出現(xiàn)不適應(yīng)狀況。針對上述原因，《中華人民共和國對加工貿(mào)易貨 物監(jiān)管辦法》也就應(yīng)運(yùn)而生，對以往規(guī)定進(jìn)行了整合與規(guī)范，并于2004年4月1日開始正式實施。
    目前，我國加工貿(mào)易管理實行保稅監(jiān)管制度。從1995年開始，海關(guān)根據(jù)國務(wù)院規(guī)定，對加工貿(mào)易實行銀行保證金臺帳管理制度，有效地保障了國家關(guān)稅的稅收， 但仍需進(jìn)一步完善?！逗ｊP(guān)法》對海關(guān)要求企業(yè)提交擔(dān)保的范圍、方式已有原則性規(guī)定，因此，新的《加工貿(mào)易貨物監(jiān)管辦法》規(guī)定海關(guān)對加工貿(mào)易實行擔(dān)保制度， 規(guī)定了擔(dān)保適用的有關(guān)情形，規(guī)定了擔(dān)保的解除條件。
    核查是加工貿(mào)易海關(guān)監(jiān)管的手段，因此《加工貿(mào)易貨物監(jiān)管辦法》明確了海關(guān)“核查”的法律地位，保留了海關(guān)對企業(yè)進(jìn)行勘驗、核查的權(quán)力，規(guī)定海關(guān)根據(jù)監(jiān)管需 要，可以對企業(yè)進(jìn)行核查，企業(yè)應(yīng)當(dāng)予以配合。另一方面，加工貿(mào)易海關(guān)監(jiān)管還應(yīng)與企業(yè)管理密切聯(lián)系，關(guān)注的重點(diǎn)從貨物轉(zhuǎn)到企業(yè)與貨物并重，重點(diǎn)放在企業(yè)自 管。要求加工貿(mào)易企業(yè)須經(jīng)海關(guān)注冊登記，按規(guī)定設(shè)置并向海關(guān)報送有關(guān)帳簿、報表和其他單證。
    另外，進(jìn)一步完善加工貿(mào)易和保稅監(jiān)管法規(guī)體系，建立健全“企業(yè)自管、海關(guān)監(jiān)管、地方政府協(xié)管、社會共管”的綜合治理機(jī)制等工作，中國海關(guān)海關(guān)實行聯(lián)網(wǎng)監(jiān) 管。來自海關(guān)總署的資料顯示，到2005年底，海關(guān)共對2,290家大型加工貿(mào)易企業(yè)實施了聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管，聯(lián)網(wǎng)企業(yè)加工貿(mào)易進(jìn)出口值已占中國全部加工貿(mào)易進(jìn)出口值的56.5%。