作為東部生態(tài)軸的重要節(jié)點，廣州大學(xué)城已形成完備的立體交通網(wǎng)絡(luò)。

1 公交：20余條公交線路。連接島內(nèi)外線路：35、番52、86、252、306、310、332、565、夜48、夜50，大學(xué)城專線1至6，廣東科學(xué)中心專線1，純電動公交試驗線路801路。島內(nèi)線路：380A、381、382、383、384、387等。

2 地鐵4號線：島內(nèi)設(shè)廣州地鐵大學(xué)城北、大學(xué)城南2站。從廣州南站可以乘坐地鐵二號線到昌崗轉(zhuǎn)地鐵八號線再到萬勝圍轉(zhuǎn)地鐵四號線到大學(xué)城。從廣州火車站、廣州汽車客運站、廣東省汽車客運站、或滘口汽車客運站可以乘坐地鐵五號線到車陂南轉(zhuǎn)地鐵四號線到大學(xué)城。從廣州東站、廣州東站汽車客運站、廣州天河客運站或廣州白云機場可以乘坐地鐵三號線到客村轉(zhuǎn)地鐵八號線再到萬勝圍轉(zhuǎn)地鐵四號線到大學(xué)城。

3 地鐵7號線：位于大學(xué)城南站，直達廣州南站，接駁京廣高鐵、廣深高鐵、廣珠輕軌。在建，2015年開通。

4 地鐵12號線：位于大學(xué)城南站，直達客村、濱江東、二沙島、烈士陵園、建設(shè)六馬路、淘金。已規(guī)劃，預(yù)計2020年開通。

5 侖頭隧道：位于大學(xué)城北側(cè)，接駁科韻路、新滘東路、環(huán)城高速等多條道路。

6 南沙港快速：位于大學(xué)城西側(cè)，廣美、華師附近出入口，直達南沙、中山、珠海。

7京港澳高速(京珠高速公路）延長線：位于大學(xué)城東側(cè)，廣中醫(yī)附近長洲出入口，在建。

8 新造隧道：位于中八路與外環(huán)路交匯處，直達廣州國際創(chuàng)新城啟動區(qū)（大學(xué)城二期），已規(guī)劃。

9 南洲路延長線：位于現(xiàn)小洲便橋，將接駁海珠環(huán)島路，直達海珠生態(tài)城，已招標(biāo)。

10 洛溪隧道：位于大學(xué)城西端廣東科學(xué)中心附近，直達洛溪島，遠(yuǎn)期規(guī)劃。

11 水上BRT：中大碼頭-大學(xué)城碼頭，預(yù)計2016年通航?，F(xiàn)有輪渡至新造、黃埔。

12 游艇：位于大學(xué)城北側(cè)生物島。《廣東省濱海旅游發(fā)展規(guī)劃（2011-2020年）》規(guī)劃建設(shè)廣東四大游艇基地：廣州南沙、生物島、珠海平沙和深圳大鵬灣。