審單作業(yè)、物流監(jiān)控和職能管理三大系統(tǒng)既相互支持配合、又相互監(jiān)督制約，形成一個有機(jī)的整體，共同構(gòu)筑新型海關(guān)管理模式。
　　審單作業(yè)系統(tǒng)是在各業(yè)務(wù)部門共同支持和參與下，包括計算機(jī)電子審單、審單中心專業(yè)化審單和隸屬海關(guān)現(xiàn)場接單審核在內(nèi)的，既分工協(xié)作又相互制約的報關(guān)單證和數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)。
　　物流監(jiān)控系統(tǒng)是以現(xiàn)代科技手段為依托，以貨物流為基礎(chǔ)，實行計算機(jī)數(shù)據(jù)底帳（信息流）與貨物流相互印證，對進(jìn)出境運輸工具、監(jiān)管區(qū)域、監(jiān)管場所和海關(guān)監(jiān)管貨物實行全方位、全過程有效監(jiān)控的作業(yè)系統(tǒng)。
　　職能管理系統(tǒng)是以通關(guān)前的審批、注冊、備案、參數(shù)維護(hù)、風(fēng)險布控，以及通關(guān)后對通關(guān)數(shù)據(jù)的綜合分析、效能評估、跟蹤稽查和監(jiān)督檢查為主要管理方式的業(yè)務(wù)運行管理系統(tǒng)。