保密審查員對(duì)確定需要保密的專利申請(qǐng)案卷做出保密標(biāo)記，建立保密案卷位置狀態(tài)卡，在計(jì)算機(jī)系統(tǒng)中做出處理，在對(duì)該專利申請(qǐng)作出解密決定之前，對(duì)其進(jìn)行管理。
保密專利申請(qǐng)的初步審查和實(shí)質(zhì)審查均由國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局專利局指定的審查員進(jìn)行。初步審查按照與一般發(fā)明專利申請(qǐng)相同的基準(zhǔn)進(jìn)行，初步審查合格的保密專利申請(qǐng)不予公布，已有實(shí)質(zhì)審查請(qǐng)求并繳納實(shí)質(zhì)審查費(fèi)的，直接進(jìn)入實(shí)質(zhì)審查程序。
實(shí)質(zhì)審查按照與一般發(fā)明專利申請(qǐng)相同的基準(zhǔn)進(jìn)行。經(jīng)實(shí)質(zhì)審查沒有發(fā)現(xiàn)駁回理由的，作出授予專利權(quán)通知，并由保密審查員通知申請(qǐng)人辦理專利權(quán)登記手續(xù)。
保密專利申請(qǐng)的授權(quán)公告僅公布專利分類號(hào)、專利號(hào)、專利申請(qǐng)日和授權(quán)公告日。