第五條 商務部是出口加工區(qū)加工貿易的政策業(yè)務主管部門。出口加工區(qū)管理委員會（以下簡稱管委會）負責出口加工區(qū)加工貿易業(yè)務管理工作，出口加工區(qū)所在省、自治區(qū)、直轄市、計劃單列市、新疆生產建設兵團及哈爾濱、長春、沈陽、南京、廣州、成都、西安、武漢市商務主管部門（以下簡稱省級商務主管部門）歸口管理其加工貿易業(yè)務。

第六條 出口加工區(qū)要遵循國家有關產業(yè)政策導向，著力吸引技術水平高、增值含量大的加工貿易企業(yè)和帶動配套能力強的大型下游企業(yè)入?yún)^(qū)。出口加工區(qū)內禁止開展高耗能、高污染等不符合國家產業(yè)政策發(fā)展要求的加工貿易業(yè)務。東部沿海地區(qū)的出口加工區(qū)要提高產業(yè)層次，不再新批低水平、低附加值的勞動密集型企業(yè)入?yún)^(qū)；中西部地區(qū)的出口加工區(qū)要結合本地區(qū)自身優(yōu)勢，有選擇地發(fā)展當?shù)靥厣隹诩庸I(yè)，并積極承接東部沿海地區(qū)梯度轉移的產業(yè)。

第七條 出口加工區(qū)內企業(yè)開展加工貿易業(yè)務，須憑企業(yè)設立的有效批準文件，向管委會提交開展加工貿易業(yè)務的書面申請報告，對有特殊規(guī)定的項目，須提供有關部門出具的相關批準文件。申請報告要說明企業(yè)開展加工貿易業(yè)務的方式和內容，并附需要進口的加工生產用設備、料件或需要出口的制成品清單。

第八條 管委會收到企業(yè)申請后，要按照國家有關規(guī)定進行審核，對符合條件的加工貿易業(yè)務，在10個工作日內簽發(fā)《出口加工區(qū)加工貿易業(yè)務批準證》和所附清單（格式附后），海關憑加蓋管委會印章的《出口加工區(qū)加工貿易業(yè)務批準證》為企業(yè)進行注冊備案。

第九條 在具備條件的地區(qū)，企業(yè)應通過'口岸電子執(zhí)法系統(tǒng)'向管委會報送申請報告和所附清單，管委會通過'口岸電子執(zhí)法系統(tǒng)'核準企業(yè)報送的申請和所附清單，海關憑管委會核準的電子文件進行注冊備案。

第十條 出口加工區(qū)內企業(yè)在海關辦理注冊備案后，方可在管委會批準的范圍內開展加工貿易業(yè)務。如需開展超出原批準范圍的加工貿易業(yè)務，須按本辦法第七條規(guī)定到管委會辦理核準手續(xù)。

第十一條 管委會要在每年1月15日前將上一年度出口加工區(qū)審批情況匯總，并報省級商務主管部門，省級商務主管部門將相關材料報商務部。